Trung tâm Bảo trợ xã hội thành phố Cần Thơ được thành lập từ năm 2005 theo Quyết định số 35/2005/QĐ-UB ngày 10/5/2005 của Ủy ban nhân dân thành phố Cần Thơ về việc thành lập và quy định chức năng, nhiệm vụ của Trung tâm Bảo trợ Xã hội người tâm thần trực thuộc Sở Lao động - Thương binh và Xã hội thành phố Cần Thơ;
Căn cứ các quy định pháp luật Ủy ban nhân dân thành phố ban hành Quyết định số 2377/QĐ-UBND ngày 30/8/2010 của Ủy ban nhân dân thành phố Cần Thơ về việc thành lập Trung tâm Bảo trợ Xã hội - Người tâm thần trực thuộc Sở Lao động - Thương binh và Xã hội thành phố Cần Thơ; thay thế Quyết định số 35/2005/QĐ-UB ngày 10/5/2005;
Thực hiện đổi tên theo Quyết định số 3037/QĐ-UBND ngày 30/9/2013 của Ủy ban nhân dân thành phố Cần Thơ về việc đổi tên thành Trung tâm Bảo trợ Xã hội - Người tâm thần thành Trung tâm Bảo trợ xã hội thành phố Cần Thơ trực thuộc Sở Lao động - Thương binh và Xã hội;
Trung tâm là đơn vị sự nghiệp công lập trực thuộc Sở Lao động - Thương binh và xã hội có chức năng tiếp nhận, quản lý, chăm sóc, nuôi dưỡng, giáo dục hướng nghiệp, hỗ trợ điều trị phục hồi chức năng cho các đối tượng bảo trợ xã hội và các đối tượng khác do Chủ tịch Ủy ban nhân dân thành phố quyết định theo quy định của pháp luật. Trung tâm có tư cách pháp nhân, có con dấu, tài khoản riêng và trụ sở hoạt động theo quy định pháp luật;
Trung tâm quản lý, nuôi dưỡng, chăm sóc thường xuyên trên 560 đối tượng tâm thần và lang thang cơ nhỡ không nơi nương tựa;
Địa chỉ chỗ làm việc hiện nay: Khu vực Bình Hòa A, phường Phước Thới, quận Ô Môn, thành phố Cần Thơ;
Cơ sở vật chất: Tổng diện tích đất tự nhiên: 36.313,4 m2; Tổng diện tích xây dựng: 13.893,04 m2. Tổng diện tích sử dụng: 15.913,03 m2;
Chế độ chính sách nuôi dưỡng các đối tượng tại Trung tâm thực hiện theo Nghị quyết số 13/2022/NQ-HĐND ngày 09/12/2022 của Hội đồng nhân dân thành phố Cần Thơ quy định mức chuẩn trợ giúp xã hội, mức trợ giúp xã hội và đối tượng khó khăn khác chưa được quy định tại Nghị định số 20/2021/NĐ-CP;
Cơ cấu tổ chức gồm: Ban giám đốc và 03 Phòng chức năng: Phòng Hành chính, Phòng Y tế và Phòng Chăm sóc;
Tổng số viên chức, người lao động: 109 người.
Trải qua gần 19 hoạt động Trung tâm luôn hoàn thành tốt các chức năng, nhiệm vụ được giao.
